+7 (495) 502-59-93+7 (4967) 33-06-09info@okabiolab.ru

Illumina

продукт(ов)

Секвенатор HiSeq 2500, Illumina

Артикул: HiSeq 2500
Принцип секвенирования основан на технологии Solexa, включающей обогащение методом bridge-ПЦР на проточном чипе, секвенирование методом синтеза (SBS) с использовани...

Принцип секвенирования основан на технологии Solexa, включающей обогащение методом bridge-ПЦР на проточном чипе, секвенирование методом синтеза (SBS) с использованием флуоресцентно-меченных нуклеотидов и детекцию света флуоресценции от кластеров ДНК.

Аналогичен и , но помимо запуска одного проточного чипа в режиме HighOutput (аналогично ) или RapidRun (аналогично ), возможен запуск двух проточных чипов в режиме HighOutput (аналогично ) для увеличения производительности за запуск прибора или RapidRun для ускорения запуска.

суммарная производительность в режиме RapidRun при запуске двух проточных чипов, п.н. при длине чтения, п.н./ за время запуска:— от 18 до 22×109 при 1×35 за 7 ч.;— от 50 до 60×109 при 2×50 за 16 ч.;— от 100 до 120×109 при 2×100 за 27 ч.;— от 150 до 180×109 при 2×150 за 40 ч.;длина чтений, п.н. — 150;максимальное количество успешных одноконцевых чтений за запуск — 600×106;максимальное количество успешных парноконцевых чтений за запуск — 1,2×109.

0

Секвенатор HiSeq 2000, Illumina

Артикул: HiSeq 2000
Принцип секвенирования основан на технологии Solexa, включающей обогащение методом bridge-ПЦР на проточном чипе, секвенирование методом синтеза (SBS) с использовани...

Принцип секвенирования основан на технологии Solexa, включающей обогащение методом bridge-ПЦР на проточном чипе, секвенирование методом синтеза (SBS) с использованием флуоресцентно-меченных нуклеотидов и детекцию света флуоресценции от кластеров ДНК.

Аналогичен , но помимо запуска одного проточного чипа, в режиме HighOutput возможен запуск двух проточных чипов для увеличения производительности за запуск;

Суммарная производительность, п.н. при длине чтения, п.н./время запуска:— от 95 до 105×109 при 1×35 за 2 дня;— от 270 до 300×109 при 2×50 за 5,5 дней;— от 540 до 600×109 при 2×100 за 11 дней;длина чтений, п.н. — 100;максимальное количество успешных одноконцевых чтений за запуск — 3×109;максимальное количество успешных парно-концевых чтений за запуск — 6×109;производительность, п.н. / день — до 55×109 (2×100).

0

Секвенатор MiSeq, Illumina

Артикул: MiSeq
Настольный интегрированный инструмент для NGS, включающий в одном приборе блоки для подготовки образцов (образования кластеров), секвенирования и обработки данных и...

Настольный интегрированный инструмент для NGS, включающий в одном приборе блоки для подготовки образцов (образования кластеров), секвенирования и обработки данных и интерфейс для управления.

Принцип секвенирования основан на технологии Solexa, включающей обогащение методом bridge-ПЦР на проточном чипе, секвенирование методом синтеза (SBS) с использованием флуоресцентно-меченных нуклеотидов и детекцию света флуоресценции от кластеров ДНК.

Основные применения:

ресеквенирование ампликоновых библиотек;проверка результатов клонирования и генной модификации;мультиплексное высокопроизводительное секвенирование малых геномов (например, микроорганизмов);таргетное высокопроизводительное секвенирование геномов для анализа генетически-ассоциированных болезней;поиск мутаций;HLA-типирование;секвенирование малых РНК;эпигенетические исследования, анализ профиля метилирования;целевое ресеквенирование и секвенирование de novo и т. д.Суммарная производительность, п.н. при длине чтения, п.н. за время запуска:— от 540 до 610×106 при 1×36 за 4 ч.;— от 750 до 850×106 при 2×25 за 5,5 ч.;— от 3,0 до 3,4×109 при 2×100 за 16,5 ч.;— от 4,5 до 5,1×109 при 2×150 за 24 ч;— от 7,5 до 8,5×109 при 2×250 за 39 ч;— к концу 2013 года, после выхода обновления прибора, химии и ПО, ожидается увеличение до 15×109 при 2×300 за 50 ч;максимальная длина чтения (одноконцевого / парноконцевого), нуклеотидов — 250/500;стандартные длины считываемых фрагментов ДНК при чтении с обоих концов: 2×25, 2×50, 2×75, 2×100, 2×150, 2×250;количество успешных прочтений за запуск:— от 12 до 15×106 для одноконцевых чтений в н. в., к концу 2013 г — от 22 до 2×106;— от 24 до 30×106 для парных прочтений в н. в., к концу 2013 г — от 44 до 50×106;процент оснований в каждом прочтении, точность чтения для которых превышает 99,9 % (Q30) при длине чтения, п.н.:— 90 % при 1×36;— 90 % при 2×25;— 85 % при 2×100;— 80 % при 2×150;— 70 % при 2×250;— 70 % при ожидающейся к концу 2013 года длине чтения 2×300;возможности мультиплексирования за счет смешивания образцов в одной пробе — до 96 с помощью комбинации мультиплексных идентификаторов с каждого конца при парно-концевых чтениях (8×12); реагенты TruSeq реализуют метод обратимого терминального включения флуоресцентно-меченного основания, позволяют детектировать сигнал от отдельного нуклеотида, после чего терминатор удаляется;для приготовления shotgun-библиотек имеется специально разработанный набор реагентов Nextera для фрагментирования ДНК на основе фермента транспозазы;метод пробоподготовки и проведения клональной амплификации — с ипользованием эмульсионной ПЦР или без использования эмульсионной ПЦР (на выбор);необходимое количество ДНК образца для секвенирования — 50 нг (реагенты Nextera) / от 100 нг до 1 мкг (реагенты TruSeq) / от 1 нг геномной ДНК;количество различных ампликонов, анализируемых за один запуск прибора — до 36’000;обработка полученных данных осуществляется первоначально непосредственно ПО прибора и занимает от 2 ч (парно-концевые чтения 2×250) до 24 ч (метагеномный анализ по 16S РНК), после чего биоинформатическая обработка данных может осуществляться с помощью бесплатного защищенного облачного сервиса BaseSpace (порядка 8 ч), для которого требуется только доступ в Интернет.

0