Анализаторы генетические (секвенаторы) капиллярные, по Сэнгеру

продукт(ов)

Секвенатор ДНК PyroMark Q24, Qiagen

Артикул: PyroMark Q24
Серия PyroMark, Qiagen — сочетают надежные количественные результаты с секвенированием в течение нескольких минут в режиме реального времени. Области применен...

Серия PyroMark, Qiagen — сочетают надежные количественные результаты с секвенированием в течение нескольких минут в режиме реального времени.

Области применения:

клинические и научные исследования;детектирование генетических полиморфизмов;мониторинг и выявление соматических мутаций при развитии онкологических заболеваний;эпигенетические исследования (анализ статуса метилирования);обнаружение единичных однонуклеотидных замен, вставок и делеций (SNP), исследование и анализ редких мутаций;количественный анализ частот аллельной встречаемости.

PyroMark Q24 — компактен, прост в обращении и сервисном обслуживании.

Для генетического анализа 24 образцов;короткие чтения (от 60 до 200 п.н.);производительность за запуск, п.н. — 1,4 — 4,8×103.

Комплект поставки: анализатор PyroMark Q24, ПО, станция вакуумной пробоподготовки, набор реагентов и контролей.

— это определение их первичной нуклеотидной последовательности.

Некоторые задачи генетического анализа:

расшифровка абсолютно неизвестных последовательностей ДНК, например, генома какого-нибудь нового вида (секвенирование «de novo»); обнаружение индивидуальных отличий конкретного образца от обобщенной последовательности, которая в общих чертах уже известна (ресеквенирование); анализ генетических полиморфизмов, включая однонуклеотидные (SNP-типирование); анализ эпигенетических модификаций ДНК, например профиля метилирования; анализ профиля экспрессии отдельных клеток секвенированием кДНК, полученной из тотальной мРНК клетки, например, для диагностики вирусных и раковых заболеваний и др.

Методы секвенирования.

метод Сэнгера.Метод секвенирования НК путем «обрыва цепи» (Ф.Сэнгер) основан на синтезе новой ДНК-цепи на анализируемой ДНК-матрице с участием ДНК-полимеразы в присутствии праймера и смеси дезоксинуклеотидтрифосфатов (dATP, dGTP, dCTP, dTTP) и на случайном обрыве синтезируемой цепи при встраивании одного из меченных разными флуоресцентными красителями дидезоксинуклеотидов (ddATP, ddGTP, ddCTP, ddTTP). Поскольку «обрыв цепи» происходит статистически, то получается весь набор ДНК-фрагментов, отличающихся между собой по длине всего на один нуклеотид. Затем полученная смесь ДНК-фрагментов обрабатывается формамидом для расхождения цепей и подвергается в полиакриламидном геле, в результате чего фрагменты распределяются по длине. Сканирование лазером, возбуждающим флуоресценцию красителей, которыми были помечены дидезоксинуклеотидфосфаты, позволяет определить последовательность нуклеотидов исходной молекулы НК.

Метод секвенирования НК (П. Ниреном) основан на синтезе новой ДНК-цепи на иммобилизированной анализируемой ДНК-матрице с участием ДНК-полимеразы в присутствии праймера при последовательном добавлении каждого дезоксинуклеотидтрифосфата (dATP, dGTP, dCTP, dTTP). При встраивании нуклеотида стехиометрически высвобождается пирофосфат (PPi). Пирофосфат (PPi) ферментом ATP-сульфурилазой в присутствии аденозин-5’-фосфосульфата (dATPαS) превращается в ATP, которая является «топливом» для фермента люциферазы, превращающей люциферин в оксилюциферин с испусканием света. Свет регистрируется камерой и далее анализируется компьютерной программой. Невстроенные нуклеотиды подвергаются деградации ферментом апиразой, и реакция начинается с новым нуклеотидом.

Бисульфитный метод.Метод для определения паттерна (профиля) метилирования ДНК основан на бисульфитной обработке ДНК, первращающей остатки цитозина в остатки урацила, но не затрагивающей метилированные остатки 5-метилцитозина. Дальнейший анализ сводится к различению однонуклеотидных полиморфизмов, и к разделению цитозинов и тиминов в прочитанных последовательностях.

Классификация генетических анализаторов.По гомогенности пробы:— гомогенная проба (очищенный раствор молекул НК, полученных из одного источника, одинаковой структуры и практически одинаковой длины) — — негомогенная проба («библиотека» молекул НК, которые могут отличаться по длине, по структуре и могут быть получены из различных источников) — . По длине прочтений:— короткие чтения;— средние чтения;— длинные чтения. По используемой технологии:— ;— ;— ;— ;— ;— ;— . По количеству отдельных чтений за запуск. По количеству одновременно анализируемых образцов (мультиплексирование). По времени, необходимому на запуск. По дополнительным требованиям. По стоимости секвенатора. По стоимости одного запуска. По стоимости анализа отдельной пробы. По методам генетического анализа.

В секвенаторах для анализа используется гомогенная проба. Обычно до начала секвенирования производят участков ДНК, последовательность которых требуется определить, при помощи . В результате получается гомогенная проба одинаковых ДНК-фрагментов. Негомогенность исходной пробы, или ошибки в ходе ПЦР-реакции могут привести к тому, что не удастся однозначно определить генетическую структуру молекулы нуклеиновой кислоты.

0 €

Секвенатор ДНК 3730xl, 96 капилляров, Thermo Fisher Scientific

Артикул: 4365481
Высокопроизводительная система капиллярного электрофореза.Оптическая система:— аргон-ионный многоволновой лазер с двусторонним освещением всех капилляров;&mda...

Высокопроизводительная система капиллярного электрофореза.

Оптическая система:— аргон-ионный многоволновой лазер с двусторонним освещением всех капилляров;— длина волн возбуждения, нм — 488 и 514,5;— блок детекции — утонченная с обратной стороны ССD-камера, обеспечивает низкий шум и полный сбор данных от всех капилляров одновременно;96 капилляров, повышенная производительность;автоматическая замена геля;автоматическая работа 48 часов без оператора;автозагрузчик 96/384 образцов;производительность за запуск, п.н. — 38,4 — 96,0×103;встроенный считыватель штрих-кодов;прогреваемая капиллярная пластина — управление температурой капилляра, °С — от 18 до 70;габариты, ШхГхВ, мм — 1000×730×890;вес, кг — 180.

Комплект поставки: секвенатор с ПК, ПО Sequencing Analysis, 2 капиллярных картриджа, инсталляционный набор реагентов (по запросу).

Расходные материалы: полимер, капилляры и буферы для стандартного, ускоренного, быстрого, длинного и экстра- длинного секвенирования, микросателлитного анализа, SNP анализа, AFLP анализа, LOH анализа; специализированные наборы для проведения анализа.

Расходные материалы и наборы для проведения анализа — по запросу.

— это определение их первичной нуклеотидной последовательности.

Некоторые задачи генетического анализа:

расшифровка абсолютно неизвестных последовательностей ДНК, например, генома какого-нибудь нового вида (секвенирование «de novo»);обнаружение индивидуальных отличий конкретного образца от обобщенной последовательности, которая в общих чертах уже известна (ресеквенирование);анализ генетических полиморфизмов, включая однонуклеотидные (SNP-типирование);анализ эпигенетических модификаций ДНК, например профиля метилирования;анализ профиля экспрессии отдельных клеток секвенированием кДНК, полученной из тотальной мРНК клетки, например, для диагностики вирусных и раковых заболеваний и др.

Методы секвенирования.

метод Сэнгера.Метод секвенирования НК путем «обрыва цепи» (Ф.Сэнгер) основан на синтезе новой ДНК-цепи на анализируемой ДНК-матрице с участием ДНК-полимеразы в присутствии праймера и смеси дезоксинуклеотидтрифосфатов (dATP, dGTP, dCTP, dTTP) и на случайном обрыве синтезируемой цепи при встраивании одного из меченных разными флуоресцентными красителями дидезоксинуклеотидов (ddATP, ddGTP, ddCTP, ddTTP). Поскольку «обрыв цепи» происходит статистически, то получается весь набор ДНК-фрагментов, отличающихся между собой по длине всего на один нуклеотид. Затем полученная смесь ДНК-фрагментов обрабатывается формамидом для расхождения цепей и подвергается в полиакриламидном геле, в результате чего фрагменты распределяются по длине. Сканирование лазером, возбуждающим флуоресценцию красителей, которыми были помечены дидезоксинуклеотидфосфаты, позволяет определить последовательность нуклеотидов исходной молекулы НК.

Метод секвенирования НК (П. Ниреном) основан на синтезе новой ДНК-цепи на иммобилизированной анализируемой ДНК-матрице с участием ДНК-полимеразы в присутствии праймера при последовательном добавлении каждого дезоксинуклеотидтрифосфата (dATP, dGTP, dCTP, dTTP). При встраивании нуклеотида стехиометрически высвобождается пирофосфат (PPi). Пирофосфат (PPi) ферментом ATP-сульфурилазой в присутствии аденозин-5’-фосфосульфата (dATPαS) превращается в ATP, которая является «топливом» для фермента люциферазы, превращающей люциферин в оксилюциферин с испусканием света. Свет регистрируется камерой и далее анализируется компьютерной программой. Невстроенные нуклеотиды подвергаются деградации ферментом апиразой, и реакция начинается с новым нуклеотидом.

Бисульфитный метод.Метод для определения паттерна (профиля) метилирования ДНК основан на бисульфитной обработке ДНК, первращающей остатки цитозина в остатки урацила, но не затрагивающей метилированные остатки 5-метилцитозина. Дальнейший анализ сводится к различению однонуклеотидных полиморфизмов, и к разделению цитозинов и тиминов в прочитанных последовательностях.

Классификация генетических анализаторов.По гомогенности пробы:— гомогенная проба (очищенный раствор молекул НК, полученных из одного источника, одинаковой структуры и практически одинаковой длины) — — негомогенная проба («библиотека» молекул НК, которые могут отличаться по длине, по структуре и могут быть получены из различных источников) — . По длине прочтений:— короткие чтения;— средние чтения;— длинные чтения. По используемой технологии:— ;— ;— ;— ;— ;— ;— . По количеству отдельных чтений за запуск. По количеству одновременно анализируемых образцов (мультиплексирование). По времени, необходимому на запуск. По дополнительным требованиям. По стоимости секвенатора. По стоимости одного запуска. По стоимости анализа отдельной пробы. По методам генетического анализа.

В секвенаторах для анализа используется гомогенная проба. Обычно до начала секвенирования производят участков ДНК, последовательность которых требуется определить, при помощи . В результате получается гомогенная проба одинаковых ДНК-фрагментов. Негомогенность исходной пробы, или ошибки в ходе ПЦР-реакции могут привести к тому, что не удастся однозначно определить генетическую структуру молекулы нуклеиновой кислоты.

0 €

Секвенатор ДНК 3500, 8 капилляров, Thermo Fisher Scientific

Артикул: 4405673
Количество капилляров в блоке — 8;лазерный источник света;длина волны, нм — 505;формат планшет — 96 или 384 лунки;производительность за запуск, п....
Количество капилляров в блоке — 8;лазерный источник света;длина волны, нм — 505;формат планшет — 96 или 384 лунки;производительность за запуск, п.н. — 3,2 — 8,0×103;система контроля и оптимизации расхода полимера;кассеты с РОР полимером 2х типов:— на 384 образца (60 инъекций);— на 960 образов (120 инъекций);простое и удобное ПО (в комплекте);обязательное подключение к ПК;расходные материалы — кассеты с анодным и катодным буферами (120 инъекций или 7 дней после установки), кассета с реагентом для промывки капилляров, сменный блок с капиллярами, кассета с РОР гелем;индикатор расхода реагентов с функцией календаря и уведомлением о необходимости замены;возможна модернизация до ;мощность (без компьютера), Вт — 271;габариты, ШхГхВ, мм — 610×610×720;вес, кг — 82.

Комплект поставки: генетический анализатор 3500, 8-капиллярный блок, реактивы и расходные материалы для квалификационных испытаний, управляющий компьютер с установленной программой управления и сбора данных и анализа.

Расходные материалы и наборы для проведения анализа — по запросу.

— это определение их первичной нуклеотидной последовательности.

Некоторые задачи генетического анализа:

расшифровка абсолютно неизвестных последовательностей ДНК, например, генома какого-нибудь нового вида (секвенирование «de novo»);обнаружение индивидуальных отличий конкретного образца от обобщенной последовательности, которая в общих чертах уже известна (ресеквенирование);анализ генетических полиморфизмов, включая однонуклеотидные (SNP-типирование);анализ эпигенетических модификаций ДНК, например профиля метилирования;анализ профиля экспрессии отдельных клеток секвенированием кДНК, полученной из тотальной мРНК клетки, например, для диагностики вирусных и раковых заболеваний и др.

Методы секвенирования.

метод Сэнгера.Метод секвенирования НК путем «обрыва цепи» (Ф.Сэнгер) основан на синтезе новой ДНК-цепи на анализируемой ДНК-матрице с участием ДНК-полимеразы в присутствии праймера и смеси дезоксинуклеотидтрифосфатов (dATP, dGTP, dCTP, dTTP) и на случайном обрыве синтезируемой цепи при встраивании одного из меченных разными флуоресцентными красителями дидезоксинуклеотидов (ddATP, ddGTP, ddCTP, ddTTP). Поскольку «обрыв цепи» происходит статистически, то получается весь набор ДНК-фрагментов, отличающихся между собой по длине всего на один нуклеотид. Затем полученная смесь ДНК-фрагментов обрабатывается формамидом для расхождения цепей и подвергается в полиакриламидном геле, в результате чего фрагменты распределяются по длине. Сканирование лазером, возбуждающим флуоресценцию красителей, которыми были помечены дидезоксинуклеотидфосфаты, позволяет определить последовательность нуклеотидов исходной молекулы НК.

Метод секвенирования НК (П. Ниреном) основан на синтезе новой ДНК-цепи на иммобилизированной анализируемой ДНК-матрице с участием ДНК-полимеразы в присутствии праймера при последовательном добавлении каждого дезоксинуклеотидтрифосфата (dATP, dGTP, dCTP, dTTP). При встраивании нуклеотида стехиометрически высвобождается пирофосфат (PPi). Пирофосфат (PPi) ферментом ATP-сульфурилазой в присутствии аденозин-5’-фосфосульфата (dATPαS) превращается в ATP, которая является «топливом» для фермента люциферазы, превращающей люциферин в оксилюциферин с испусканием света. Свет регистрируется камерой и далее анализируется компьютерной программой. Невстроенные нуклеотиды подвергаются деградации ферментом апиразой, и реакция начинается с новым нуклеотидом.

Бисульфитный метод.Метод для определения паттерна (профиля) метилирования ДНК основан на бисульфитной обработке ДНК, первращающей остатки цитозина в остатки урацила, но не затрагивающей метилированные остатки 5-метилцитозина. Дальнейший анализ сводится к различению однонуклеотидных полиморфизмов, и к разделению цитозинов и тиминов в прочитанных последовательностях.

Классификация генетических анализаторов.По гомогенности пробы:— гомогенная проба (очищенный раствор молекул НК, полученных из одного источника, одинаковой структуры и практически одинаковой длины) — — негомогенная проба («библиотека» молекул НК, которые могут отличаться по длине, по структуре и могут быть получены из различных источников) — . По длине прочтений:— короткие чтения;— средние чтения;— длинные чтения. По используемой технологии:— ;— ;— ;— ;— ;— ;— . По количеству отдельных чтений за запуск. По количеству одновременно анализируемых образцов (мультиплексирование). По времени, необходимому на запуск. По дополнительным требованиям. По стоимости секвенатора. По стоимости одного запуска. По стоимости анализа отдельной пробы. По методам генетического анализа.

В секвенаторах для анализа используется гомогенная проба. Обычно до начала секвенирования производят участков ДНК, последовательность которых требуется определить, при помощи . В результате получается гомогенная проба одинаковых ДНК-фрагментов. Негомогенность исходной пробы, или ошибки в ходе ПЦР-реакции могут привести к тому, что не удастся однозначно определить генетическую структуру молекулы нуклеиновой кислоты.

0 €

Секвенатор ДНК 3500xL, 24 капилляра, Thermo Fisher Scientific

Артикул: 4442010
Количество капилляров в блоке — 24;лазерный источник света;длина волны, нм — 505;формат планшет — 96 или 384 лунки;производительность за запуск, п...
Количество капилляров в блоке — 24;лазерный источник света;длина волны, нм — 505;формат планшет — 96 или 384 лунки;производительность за запуск, п.н. — 9,6 — 24,0×103;система контроля и оптимизации расхода полимера;кассеты с РОР полимером 2х типов:— на 384 образца (20 инъекций);— на 960 образов (50 инъекций);простое и удобное ПО (в комплекте);обязательное подключение к ПК;расходные материалы — кассеты с анодным и катодным буферами (120 инъекций или 7 дней после установки), кассета с реагентом для промывки капилляров, сменный блок с капиллярами, кассета с РОР гелем;индикатор расхода реагентов с функцией календаря и уведомлением о необходимости замены;мощность (без компьютера), Вт — 271;габариты, ШхГхВ, мм — 610×610×720;вес, кг — 82.

Комплект поставки: генетический анализатор 3500xL, 24-капиллярный блок, реактивы и расходные материалы для квалификационных испытаний, управляющий компьютер с установленной программой управления и сбора данных и анализа.

Расходные материалы и наборы для проведения анализа — по запросу.

— это определение их первичной нуклеотидной последовательности.

Некоторые задачи генетического анализа:

расшифровка абсолютно неизвестных последовательностей ДНК, например, генома какого-нибудь нового вида (секвенирование «de novo»);обнаружение индивидуальных отличий конкретного образца от обобщенной последовательности, которая в общих чертах уже известна (ресеквенирование);анализ генетических полиморфизмов, включая однонуклеотидные (SNP-типирование);анализ эпигенетических модификаций ДНК, например профиля метилирования;анализ профиля экспрессии отдельных клеток секвенированием кДНК, полученной из тотальной мРНК клетки, например, для диагностики вирусных и раковых заболеваний и др.

Методы секвенирования.

метод Сэнгера.Метод секвенирования НК путем «обрыва цепи» (Ф.Сэнгер) основан на синтезе новой ДНК-цепи на анализируемой ДНК-матрице с участием ДНК-полимеразы в присутствии праймера и смеси дезоксинуклеотидтрифосфатов (dATP, dGTP, dCTP, dTTP) и на случайном обрыве синтезируемой цепи при встраивании одного из меченных разными флуоресцентными красителями дидезоксинуклеотидов (ddATP, ddGTP, ddCTP, ddTTP). Поскольку «обрыв цепи» происходит статистически, то получается весь набор ДНК-фрагментов, отличающихся между собой по длине всего на один нуклеотид. Затем полученная смесь ДНК-фрагментов обрабатывается формамидом для расхождения цепей и подвергается в полиакриламидном геле, в результате чего фрагменты распределяются по длине. Сканирование лазером, возбуждающим флуоресценцию красителей, которыми были помечены дидезоксинуклеотидфосфаты, позволяет определить последовательность нуклеотидов исходной молекулы НК.

Метод секвенирования НК (П. Ниреном) основан на синтезе новой ДНК-цепи на иммобилизированной анализируемой ДНК-матрице с участием ДНК-полимеразы в присутствии праймера при последовательном добавлении каждого дезоксинуклеотидтрифосфата (dATP, dGTP, dCTP, dTTP). При встраивании нуклеотида стехиометрически высвобождается пирофосфат (PPi). Пирофосфат (PPi) ферментом ATP-сульфурилазой в присутствии аденозин-5’-фосфосульфата (dATPαS) превращается в ATP, которая является «топливом» для фермента люциферазы, превращающей люциферин в оксилюциферин с испусканием света. Свет регистрируется камерой и далее анализируется компьютерной программой. Невстроенные нуклеотиды подвергаются деградации ферментом апиразой, и реакция начинается с новым нуклеотидом.

Бисульфитный метод.Метод для определения паттерна (профиля) метилирования ДНК основан на бисульфитной обработке ДНК, первращающей остатки цитозина в остатки урацила, но не затрагивающей метилированные остатки 5-метилцитозина. Дальнейший анализ сводится к различению однонуклеотидных полиморфизмов, и к разделению цитозинов и тиминов в прочитанных последовательностях.

Классификация генетических анализаторов.По гомогенности пробы:— гомогенная проба (очищенный раствор молекул НК, полученных из одного источника, одинаковой структуры и практически одинаковой длины) — — негомогенная проба («библиотека» молекул НК, которые могут отличаться по длине, по структуре и могут быть получены из различных источников) — . По длине прочтений:— короткие чтения;— средние чтения;— длинные чтения. По используемой технологии:— ;— ;— ;— ;— ;— ;— . По количеству отдельных чтений за запуск. По количеству одновременно анализируемых образцов (мультиплексирование). По времени, необходимому на запуск. По дополнительным требованиям. По стоимости секвенатора. По стоимости одного запуска. По стоимости анализа отдельной пробы. По методам генетического анализа.

В секвенаторах для анализа используется гомогенная проба. Обычно до начала секвенирования производят участков ДНК, последовательность которых требуется определить, при помощи . В результате получается гомогенная проба одинаковых ДНК-фрагментов. Негомогенность исходной пробы, или ошибки в ходе ПЦР-реакции могут привести к тому, что не удастся однозначно определить генетическую структуру молекулы нуклеиновой кислоты.

0 €

Секвенатор ДНК SeqStudio, 4 капилляра, Thermo Fisher Scientific

Артикул: A35645
Генетический 4-капиллярный анализатор SeqStudio для секвенирования по Сэнгеру и фрагментного анализа. Количество капилляров в блоке – 4; длина капилляров, см – 28; ...
Генетический 4-капиллярный анализатор SeqStudio для секвенирования по Сэнгеру и фрагментного анализа. Количество капилляров в блоке – 4; длина капилляров, см – 28; формат – 96-луночные планшеты или 8-луночные стрипы; количество детектируемых мишеней – 6; картридж до 125 запусков; простое и удобное ПО (в комплекте); обязательное подключение к ПК; мощность (без компьютера), Вт – 271; габариты, ШхГхВ, мм – 495×648×442; вес, кг – 45,4. Особенности: Универсальный – единый формат расходных материалов (универсальный картридж) и для секвенирования, и фрагментного анализа. Широкий спектр задач – весь спектр приложений капиллярного электрофореза в ваших руках. Компактный – секвенатор размером с амплификатор. Комплексный – компьютер и ПО встроены в прибор. Анализ данных осуществляется в режиме реального времени. Надежный – проверенные временем технологии. Научные, медицинские, криминалистические лаборатории всего мира доверяют данным этих генетических анализаторов. Простой – запуск прибора занимает всего несколько минут. Все необходимое для работы прибора в одном картридже, который хранится непосредственно в приборе. Программное обеспечение: Для секвенирования – Sequencing Analysis Software, SeqScape (для работы с базами данных при сравнительном секвенировании и анализе мутаций). Для детекции мутаций, SNP, контроль качества секвенирования – Variant Reporter. Для ресеквенирования – SeqScape Software. Для всех основных приложений фрагментного анализа – GeneMapper Software. Для генетических анализаторов Minor Variant Finder (поиск малопредставленных вариантов). Типирование микроорганизмов – MicroSEQ ID (приобретается отдельно).

Комплект поставки: генетический анализатор SeqStudio, 4-капиллярный блок, реактивы и расходные материалы для квалификационных испытаний, управляющий компьютер с установленной программой управления и сбора данных и анализа.

Расходные материалы и наборы для проведения анализа — по запросу.

0 €

Секвенатор ДНК 3730, 48 капилляров, Thermo Fisher Scientific

Артикул: 4365480
Высокопроизводительная система капиллярного секвенирования.Оптическая система:— аргон-ионный многоволновой лазер с двусторонним освещением всех капилляров;&md...

Высокопроизводительная система капиллярного секвенирования.

Оптическая система:— аргон-ионный многоволновой лазер с двусторонним освещением всех капилляров;— длина волн возбуждения, нм — 488 и 514,5;— блок детекции — утонченная с обратной стороны ССD-камера, обеспечивает низкий шум и полный сбор данных от всех капилляров одновременно;48 капилляров (возможность модернизации до 96- капиллярной системы );автоматическая замена геля;автоматическая работа 48 часов без оператора;автозагрузчик 96/384 образцов;производительность за запуск, п.н. — 19,2 — 48,0×103;встроенный считыватель штрих-кодов;прогреваемая капиллярная пластина — управление температурой капилляра, °С — от 18 до 70;габариты, ШхГхВ, мм — 1000×730×890;вес, кг — 180.

Комплект поставки: секвенатор с ПК, ПО Sequencing Analysis, 2 капиллярных картриджа, инсталляционный набор реагентов (по запросу).

Расходные материалы: полимер, капилляры и буферы для стандартного, ускоренного, быстрого, длинного и экстрадлинного секвенирования, микросателлитного анализа, SNP анализа, AFLP анализа, LOH анализа; специализированные наборы для проведения анализа.

Расходные материалы и наборы для проведения анализа — по запросу.

— это определение их первичной нуклеотидной последовательности.

Некоторые задачи генетического анализа:

расшифровка абсолютно неизвестных последовательностей ДНК, например, генома какого-нибудь нового вида (секвенирование «de novo»);обнаружение индивидуальных отличий конкретного образца от обобщенной последовательности, которая в общих чертах уже известна (ресеквенирование);анализ генетических полиморфизмов, включая однонуклеотидные (SNP-типирование);анализ эпигенетических модификаций ДНК, например профиля метилирования;анализ профиля экспрессии отдельных клеток секвенированием кДНК, полученной из тотальной мРНК клетки, например, для диагностики вирусных и раковых заболеваний и др.

Методы секвенирования.

метод Сэнгера.Метод секвенирования НК путем «обрыва цепи» (Ф.Сэнгер) основан на синтезе новой ДНК-цепи на анализируемой ДНК-матрице с участием ДНК-полимеразы в присутствии праймера и смеси дезоксинуклеотидтрифосфатов (dATP, dGTP, dCTP, dTTP) и на случайном обрыве синтезируемой цепи при встраивании одного из меченных разными флуоресцентными красителями дидезоксинуклеотидов (ddATP, ddGTP, ddCTP, ddTTP). Поскольку «обрыв цепи» происходит статистически, то получается весь набор ДНК-фрагментов, отличающихся между собой по длине всего на один нуклеотид. Затем полученная смесь ДНК-фрагментов обрабатывается формамидом для расхождения цепей и подвергается в полиакриламидном геле, в результате чего фрагменты распределяются по длине. Сканирование лазером, возбуждающим флуоресценцию красителей, которыми были помечены дидезоксинуклеотидфосфаты, позволяет определить последовательность нуклеотидов исходной молекулы НК.

Метод секвенирования НК (П. Ниреном) основан на синтезе новой ДНК-цепи на иммобилизированной анализируемой ДНК-матрице с участием ДНК-полимеразы в присутствии праймера при последовательном добавлении каждого дезоксинуклеотидтрифосфата (dATP, dGTP, dCTP, dTTP). При встраивании нуклеотида стехиометрически высвобождается пирофосфат (PPi). Пирофосфат (PPi) ферментом ATP-сульфурилазой в присутствии аденозин-5’-фосфосульфата (dATPαS) превращается в ATP, которая является «топливом» для фермента люциферазы, превращающей люциферин в оксилюциферин с испусканием света. Свет регистрируется камерой и далее анализируется компьютерной программой. Невстроенные нуклеотиды подвергаются деградации ферментом апиразой, и реакция начинается с новым нуклеотидом.

Бисульфитный метод.Метод для определения паттерна (профиля) метилирования ДНК основан на бисульфитной обработке ДНК, первращающей остатки цитозина в остатки урацила, но не затрагивающей метилированные остатки 5-метилцитозина. Дальнейший анализ сводится к различению однонуклеотидных полиморфизмов, и к разделению цитозинов и тиминов в прочитанных последовательностях.

Классификация генетических анализаторов.По гомогенности пробы:— гомогенная проба (очищенный раствор молекул НК, полученных из одного источника, одинаковой структуры и практически одинаковой длины) — — негомогенная проба («библиотека» молекул НК, которые могут отличаться по длине, по структуре и могут быть получены из различных источников) — . По длине прочтений:— короткие чтения;— средние чтения;— длинные чтения. По используемой технологии:— ;— ;— ;— ;— ;— ;— . По количеству отдельных чтений за запуск. По количеству одновременно анализируемых образцов (мультиплексирование). По времени, необходимому на запуск. По дополнительным требованиям. По стоимости секвенатора. По стоимости одного запуска. По стоимости анализа отдельной пробы. По методам генетического анализа.

В секвенаторах для анализа используется гомогенная проба. Обычно до начала секвенирования производят участков ДНК, последовательность которых требуется определить, при помощи . В результате получается гомогенная проба одинаковых ДНК-фрагментов. Негомогенность исходной пробы, или ошибки в ходе ПЦР-реакции могут привести к тому, что не удастся однозначно определить генетическую структуру молекулы нуклеиновой кислоты.

0 €

Секвенатор Нанофор-05, 8 капилляров, Синтол

Артикул: Нанофор-05
Количество капилляров, шт. – 8;формат проб – микропланшетный, 96 х 0,2 мл;детектор – флуориметрический;тип лазера – твердотельный;длина волны лазера, нм – 488;мощно...
Количество капилляров, шт. – 8;формат проб – микропланшетный, 96 х 0,2 мл;детектор – флуориметрический;тип лазера – твердотельный;длина волны лазера, нм – 488;мощность лазера, мВт – 20;диапазон длин волн детектора, нм. – от 520 до 710;детекция сигнала флуоресценции в пяти каналах, нм - 520, 550, 580, 610 и 650;общее количество каналов детектора, шт. – 7;материал капилляров – кварц;диаметр капилляров, наружный / внутренний, мкм – 200 / 75;термостатирование капилляров в диапазоне температур, °С – от 30 до 60 ± 0,2 °С;разрешение одноцепочечных фрагментов ДНК с шагом в 1 нуклеотид с достоверностью > 98% для фрагментов длиной до, нуклеотидов – 700;автоматическое перезаполнение геля под давлением, атм – до 70;автоматическое разделения фрагментов ДНК по заданной программе с контролем процесса и параметров эксперимента в реальном времени;совместимость с наборами для капиллярного электрофореза LifeTechnologies (Thermo), Promega, Qiagen;среднее время анализа, ч – 1,5;значение напряжения источника, кВ – до 20;потребляемая мощность, кВт – 0,3;габариты, Ш х Г х В, мм – 850 х 750 х 680;вес, кг – 75.Комплект поставки:держатель планшетов с фиксатором;емкости для буфера и воды;капилляры длиной, см – 35 и 50;набор для секвенирования с терминаторами;набор для секвенирования с FRET-праймерами (M13, T7);набор для идентификации личности Гордиз;набор маркеров молекулярного веса;набор спектральных калибраторов;набор флуоресцентно-меченых праймеров;универсальный полимер для секвенирования и фрагментного анализа ПДМА-6;буфер для электрофореза.

Примеры анализа и внешний вид ПО для обработки результатов:

Пример анализа последовательности ДНК с использованием программы «ДНК АЛ»:Пример разделения и анализа размерного стандарта S-450 с использованием программы «ДНК ФА»: Пример разделения и анализа аллельной лестницы из набора реагентов для мультиплексного анализа 19 STR-маркеров и локуса амелогенина человека «COrDIS Plus»: Результат анализа образца ДНК человека, полученный с помощью набора «COrDIS Plus»:

0 €