Система препаративного электрофореза для разделения и выделения только фрагментов ДНК размером от 50 до 8000 п.о.; детекция фракций осуществляется без использования УФ, что гарантирует отсутствие повреждения фрагментов.
Технические характеристики:
напряжение при электрофорезе, В — 100 или 150;ток (на каждую дорожку), мА — 2 или 3;длина волны возбуждения, нм — 535;длина детекции, нм — 640;максимальное количество ДНК:— 10 мкг фрагментированной геномной ДНК;— 4 мкг ДНК определённого размера;точность и воспроизводимость выделения, % — 5-10, в зависимости от геля;выход образца, % — 50-80;габариты, ШхГхВ, см — 18×28×53;вес, кг — 7.
Принцип работы:
В системе используются готовые кассеты на пять изолированных капилляров, заполненных агарозным гелем. В конце каждого капилляра есть Y-образное разветвление. Оба выходящих капилляра имеют независимое подключение к катодам. Движение фрагментов ДНК в капилляре как и в «классической» методике происходит под действием тока, но при приближении фрагментов ДНК требуемого размера к месту разветвления, происходит переключение катодов, и искомый фрагмент попадает в боковое ответвление капилляра и собирается в канале для сборки.
Преимущества метода:
за один сеанс система может работать параллельно с 4 образцами + 1 внешний стандарт или с 5 образцами при использовании внутреннего стандарта; время подготовки — 3 минуты, время проведения самой процедуры — 50-100 мин в зависимости от размеров фрагментов;благодаря готовым гелевым чипам достигается максимальная воспроизводимость экстракции и, как следствие, более точный результат секвенирования;каналы, в которых идёт разгонка, полностью изолированы друг от друга, что снижает риск перекрёстной контаминации;отбор осуществляется, автоматически в соответствии с заданным через ПО диапазоном длин фрагментов, что может использоваться для секвенирования спаренных концов.
Области применения:
приготовление библиотек при проведении NGS;подготовка образцов для парноконцевого секвенирования, ChIP-секвенирования;улучшение библиотек при проведении эмульсионной ПЦР;выделение белков и НК.
