Система Bioanalyzer 2100 использует микрофлюидную технологию LabChip, обеспечивает высокую точность результатов при минимальных объемах исследуемого образца.
В системе используется два принципа анализа: электрофореза и проточной цитометрии.
Источник света — светодиодный лазер; длина волны эмиссии, нм — 635; фотоэмиссионный детектор; длина волны детекции, нм — 685; фильтры эмиссии, нм — 488, 638 нм; формат — 16-луночные чипы; подключение к ПК — USB 2.0; габариты, ШхГхВ, мм — 162 × 412 × 290; вес, кг — 10.
Принцип работы: в системе применяют готовые чипы, заполненные агарозным гелем. Движение фрагментов ДНК в капилляре, как и в «классической» методике, происходит под действием тока. Для определения размеров НК, белков используют маркеры, окрашенные интеркалирующими и флуоресцентными красителями.
В случае применения цитометрического модуля: клеточная суспензия, предварительно меченная флюоресцирующими моноклональными антителами или флуоресцентными красителями, попадает в поток жидкости, проходящий через проточную ячейку. Условия подобраны таким образом, что клетки выстраиваются друг за другом за счет т. н. гидродинамического фокусирования струи в струе. В модуле возможно изучение зелёной и красной флуоресценции. Все результаты обрабатываются с помощью ПО 2100 Expert.
Области применения:
Приготовление библиотек при проведении NGS на секвенаторах ДНК HiScan SQ, HiSeq 2000, MiSeq (Illumina), 5500 xl W, 5500w, Ion Torrent IonProton, Ion Torrent PGM (Life Technologies); GS FLX+, GS Junior (Roche); подготовка образцов для парноконцевого секвенирования, ChIP-секвенирования; выделение белков и НК. контроль качества синтезированной in vitro матричной РНК, контроль чистоты выделенной РНК (RIN - RNA Integrity Number); определение уровня апоптоза; оценка жизнеспособности и пролиферации клеток; оценка экспрессии белков, в результате связывания с антителами; оценка экспрессии белков с помощью зелёного флуоресцентного белка (green fluorescent protein, GFP); оценка эффективности трансфекции миРНК (siRNA).
Преимущества:
Система позволяет анализировать ДНК, РНК, белки, клетки с использованием одного прибора; чувствительность, пг/мкл – 5 (для ДНК), 50 (для РНК), 1 (для белков); максимальная загрузка чипа — до 12 образцов на один чип; объем исходного образца, мкл — 1 (для ДНК и РНК), 4 (для белков), 10 мкл (для клеток); время анализа, мин — 25-45, в зависимости от используемого чипа.
Комплект поставки: станция подготовки чипов, вортекс IKA, ПО 2100 Expert, набор для электрофореза (приобретается дополнительно), набор для проточной цитометрии (приобретается дополнительно), ПК или ноутбук (приобретается дополнительно).
Характеристики чипов:
Образцы
High Sensitivity DNA
DNA 1000
DNA 7500
DNA 12000
Диапазон размеров, п.н.
50–7000
25–1000
100–7500
100–12000
Диапазон концентраций
5–500 пкг/мкл
0,5–50 нг/мкл
0,5–50 нг/мкл
0,5–50 нг/мкл
Время анализа, мин
45
35
30
30
Число образцов
11
12
12
12
Образцы
RNA 6000 Nano
Total RNA
RNA 6000 Nano
mRNA
RNA 6000 Pico
Total RNA
RNA 6000 Pico
mRNA
Small RNA
Количественный диапазон концентраций
25–500 нг/мкл
25–250 нг/мкл
-
-
50–2000 пкг/мкл
очищенной miRNA в воде
Качественный диапазон концентраций
5–500 нг/мкл
25–250 нг/мкл
50–5000 пкг/мкл в воде
250–5000 пкг/мкл
в воде
50–2000 pg/μL
очищенной miRNA в воде
Время анализа, мин
30
30
30
30
30
Число образцов
12
12
11
11
11
Образцы
Protein 80
Protein 230
High Sensitivity Protein 250
Диапазон размеров, кДа
5–80
14–230
10–250
Диапазон концентраций
60–2000 нг/мкл
15–2000 нг/мкл
0,3–3000 нг/мкл
Время анализа, мин
30
25
30
Число образцов
10
10
10
Образцы
Клетки
Красный канал
возбуждение - 620–645 нм;
эмиссия - 674–696 нм.
Синий канал
возбуждение - 458–482 нм;
эмиссия - 510–540 нм.
Минимальная клеточная пропускная способность
2,5 клетки / секунды
Минимальная плотность, кл/мл
2,0 x 106
Время анализа, мин
30
Количество образцов
6
Объём образца, мкл
10 (клеток 2 x 104 в мл)
Видео "Электрофоретическая система Bioanalyzer 2100":
